科学发展观对政府管理提出了更高的要求。它不仅要求政府要全面审视经济社会中的各种矛盾问题，还要求政府高瞻远瞩，注意把短期利益与长远利益相结合，在抓好经济建设的同时，努力实现以公共利益的和谐为宗旨的价值取向，理顺政府与社会的关系，强化政府的社会管理、公共服务职能，推进政府运行机制的创新，实现决策
机制的科学化、民主化。
树立以人为本的政府管理思想,坚持经济社会全面、协调、可持续发展的科学发展观，是政府管理创新的根本要求。坚持以人为本就是要以实现人的全面发展为目标，从人民群众根本利益出发，谋发展、促发展，不断满足人民群众日益增长的物质文化需要，切实保障人民群众的经济、政治和文化权益，让发展的成果惠及全体人民。全面发展就是要以经济建设为中心，全面推进经济、政治、文化建设，实现社会的全面进步。协调发展，就是要按照“五个统筹”的要求，充分考虑经济、社会以及资源、环境等各个环节、各个方面。可持续发展，就是要促进人和自然的和谐，实现经济发展和人口、资源、环境相协调，走生产发展、生活富裕、生态良好的文明之路，保证世代永续发展。
科学发展观为政府管理提供了新的思想。以人为本的科学发展观要求我们必须辩证地认识物质财富的增长和人的全面发展的关系，转变重物轻人的发展观念。发展应该始终把提高人民的物质文化生活水平和健康水平作为出发点和归宿。要按照“科学发展观”的要求转变经济增长方式，如果不能找到一个正确的增长方式，经济不可能长期稳定快速地发展。在全面建设小康社会的进程中，要按照科学发展观的要求，切实走出一条新型工业化道路，努力建设低投入、高产出、低消耗、少排放、能循环、可持续的节约型社会。科学发展观还要求在政府管理中必须辩证地认识经济增长和经济发展的关系，转变把经济增长简单地等同于发展的观念，也不能把发展简单地等同于经济增长。经济增长是经济发展的基础，没有经济增长谈不上经济发展，但增长又并不一定带来相应的发展。
现代政府的本质特征是公共性，政府管理是要实现公共利益最大化，公共利益也就成为政府管理的基石与出发点。要防止和克服一些领导干部在“政绩观”上存在的偏差，那种在错误发展观的支配下干出的所谓“政绩”，往往是不科学的、只注重当前发展，忽视长远发展的。正确的政绩观必须以科学的发展观为指导，完善政绩考核指标体系，使其既包含经济发展的指标，也兼顾资源、环境、生态，以及公共卫生、就业、社会保障、人民生活等社会发展的指标，并以制度作为保证。另一方面，只有树立正确的政绩观才能真正落实科学发展观。以人为本，就是要把人民的利益作为一切工作的出发点和落脚点，不断满足人们的多方面需求和促进人的全面发展。坚持以人为本要求各级领导干部把树立政绩的根本目的定位为给人民群众谋利益。妥善处理改革、发展和稳定之间的关系，真正使科学发展观落到实处，才能创造出扎扎实实的政绩。
政府职能问题是政府管理的核心问题,政府管理的创新必须通过政府的职能转变来实现。政府的职能转变是当前各类矛盾交织的汇集点，从传统的“统治型政府”模式向“公共服务型政府”模式转变，不仅能够有效地解决现实问题，而且对完善社会主义市场经济体制具有决定性意义。要全面贯彻科学发展观，政府必须坚持以社会管理与公共服务为重心,通过引入市场机制与社会服务一起为社会各方面提供所需的公共产品。